交絡する交互作用のプーリングについて

最初の質問で間違いがありました。2因子交互作用が交絡しているのは3つの列ではなく6つの列で，別名関係にある2因子交互作用の数は12です。これを承知で分散分析を行ったところ，想定していなかった交互作用が有意となりこれについて論ずる必要が出てきました。どうぞよろしくお願いします。

直交表実験の初心者で初歩的な間違いをしており，交絡という意味を全く理解していませんでした。交絡する2つの2因子交互作用は分散を分離できず効果の解釈そのものが出来ないということですね。ですから交絡している列は最初から誤差項として扱うという理解でよろしかったでしょうか。大変お恥ずかしいのですが，質問の意味をその様に変更したいと思います。よろしくお願いします。

私は農学関係の研究にかかわっており，奥野忠一著の「農業実験計画法小史」などを参考にしています。この中のp.118のL64直交表の1ブロック，10因子，1/16実施の計画に従ってわりつけして実験を行いました。計45の2因子交互作用のうち，12が別名関係となり推定不能です。最初，交絡しているのに気づかずに分散分析をおこなったところ有意となり，あとから交絡していることがわかり，どうしたものか悩んでおります。単純に誤差にプールして分散分析して良いものでしょうか。そもそも，9以上の因子をL64に割り付けた場合，かならず推定不能な2因子交互作用が出てしまいます。その列を最初から誤差として扱うことは問題がありますか。すみません，よろしくお願いします。他にも雑誌「農作業研究」37巻2号，P.81～の執行盛之著の統計講座「遠くまで飛ぶ紙ひこうきを折る」の中にもL16に5因子をわりつける例がありますが，「要因や交互作用がわりつけられていない列は全て誤差になります」との表現がありこれはどのような意味になるでしょうか。もしかしたら有意な交互作用を誤差にしてしまっている可能性があります。よろしくお願いします。